预制菜灭菌问题主要有以下几个类型：
1. 食材来源问题：预制菜的食材来源可能存在问题，比如使用了过期食材、不合格食材或者受到污染的食材。这些食材可能含有病原菌、细菌或其他有害物质，对人体健康造成威胁。
2. 加工环境问题：预制菜的加工环境可能存在卫生问题，比如加工场所不洁净、操作人员不符合卫生要求等。这些问题可能导致病原菌或细菌在加工过程中污染预制菜，增加食品安全风险。
3. 加工工艺问题：预制菜的加工工艺可能存在问题，比如加工温度不够高、加工时间不够长等。这些问题可能导致病原菌或细菌未被有效杀灭，从而使预制菜中的病原菌或细菌得以存活，增加食品安全风险。
4. 包装和储存问题：预制菜的包装和储存条件可能存在问题，比如包装不严密、储存温度不合适等。这些问题可能导致病原菌或细菌在包装和储存过程中滋生或繁殖，增加食品安全风险。
5. 运输和配送问题：预制菜的运输和配送环节可能存在问题，比如运输车辆不洁净、运输温度不合适等。这些问题可能导致病原菌或细菌在运输和配送过程中污染预制菜，增加食品安全风险。
针对以上问题，可以采取以下措施来解决预制菜灭菌问题：
1. 严格选择食材供应商，确保食材的质量和安全性。
2. 加强加工环境的卫生管理，定期进行清洁和消毒。
3. 优化加工工艺，确保加工温度和时间能够有效杀灭病原菌和细菌。
4. 完善包装和储存条件，确保预制菜在包装和储存过程中不受污染。
5. 加强运输和配送环节的管理，确保运输车辆的卫生和运输温度的合适性。
6. 建立健全的质量监控体系，加强对预制菜的抽检和监测，及时发现和处理问题。
7. 提高员工的卫生意识和操作技能，加强培训和教育。
通过以上措施的实施，可以有效解决预制菜灭菌问题，提高预制菜的质量和安全性，保障消费者的健康。